Osmanlı Devleti’nin resmî kaynaklarında “Baruthane-i Âmire” olarak geçen kurum, 1701’de üretime başlamış, üretime başladıktan kısa süre sonra 22 Ağustos 1707’de büyük bir kaza meydana gelmiş, Baruthane’nin bütün binaları yıkılmıştır. Kısa sürede onarılan Baruthane faaliyetlerine devam ederken, 1725’te bu kez de yangın çıkmıştır.
1785’te yapılan yenileme ve genişletme çalışmalarında; nöbet kuleleri, sundurmalar, kalhane, barut depoları, 18 adet çark ve barutçu başı dairesi onarılmıştır. 1791’de Baruthane’de yeniden yangın çıkmış, dönemin nazırı Ahmed Ağa yanan kısımların tamiratını yaptırmıştır. Baruthane’deki düzenin bozulması ve barut kalitesinin düşmesi üzerine düzenlemelere gidilmiş, 6 Mayıs 1793’te Baruthane Nazırlığı kurularak bütün baruthaneler buraya bağlanmıştır.
19. yüzyıl boyunca barut teknolojisindeki gelişmeye paralel olarak Baruthane’de bu yeniliklere uyacak yeni düzenlemeler yapılmıştır. Baruthane; Cumhuriyet döneminde Askerî Fabrikalar İdaresi’ne geçmiş, oradan da Makine ve Kimya Endüstrisi Kurumu’na devredilmiştir. 1953’e kadar askerî kimliğini muhafaza eden Baruthane, elektrik kontağından çıkan yangın sonucu kullanılamaz hâle gelmiştir. 4.000.000 metrekare olan baruthane arazisi 1955’te 60.000.000 lira karşılığında Türkiye Emlak ve Kredi Bankası’na satılmıştır. 15 Eylül 1957’de ise Baruthane arazisi üzerinde Ataköy sitelerinin inşasına başlanmıştır.
Baruthane’nin ana binası uzun süre metruk olarak kaldıktan sonra kaba bir yenileme ile 1972’de Ataköy Turistik Tesisleri İşletmesi tarafından Barut Fıçısı adı altında diskotek olarak işletilmiştir. Kısa süren bu maceradan sonra kaderine terk edilen bina; Bakırköy Belediyesi tarafından, Prof. Dr. Zeliha Berksoy ve tiyatro mimarisi alanının yetkin ismi Mimar Metin Deniz rehberliğinde, iki yıllık bir restorasyon faaliyetinin ardından, 3 Mart 1993’te Yunus Emre Kültür Merkezi Bakırköy Belediye Tiyatroları’nın sahnesi olarak hizmete açılmıştır.